El Museo de la Memoria y los Derechos Humanos contiene exposiciones, colecciones y actividades que le enriquecen cultural y socialmente, haciendo de él un grato sitio para conocer la historia más real de la dictadura chilena. En las colecciones se intenta mostrar la Memoria Histórica a través de la solidaridad entre las gentes, su vida cotidiana y el papel crítico de las fuerzas internacionales. Las bases documentales para la creación de éstas son los Fondos Documentales del Programa Memoria del Mundo, según la ONU y, dentro de éste, los que están recogidos en la Casa de la Memoria: FASIC, CODEPU, PIDEE y Archivos de Teleanálisis, así como aportaciones de las propias víctimas o sus familiares. Encontramos dos tipos de colecciones: las del archivo documental y las de objetos. Dentro de las primeras encontramos documentos de todo tipo y en toda clase de formatos y soportes: Documentos de la Memoria, de instituciones de la administración del Estado, publicaciones generadas en Chile o en el extranjero, informes de organismos internacionales, expedientes y legajos judiciales, archivos de prensa radial, escrita y periódicos, archivos sonoros, archivos de fotografías, documentos gráficos, archivos audiovisuales, entre los que se encuentran una colección de cien entrevistas a personas que relatan sus vivencias en cuanto a la Memoria y los Derechos Humanos, producciones especiales del museo, archivos de la memoria de Chile, archivos orales y testimonios. En cuanto a la colección de objetos, éstos expresan un gran simbolismo, encontrando cuatro tipos: los que conmemoran a las víctimas (objetos personales o artesanía carcelaria), los representativos de los lugares de Memoria (tortura, inhumaciones, detenciones), los de las manifestaciones y los referidos a organismos de Derechos Humanos. Las colecciones llegan de forma voluntaria, la mayoría de veces, por parte de la familia o víctima (el listado de donantes se muestra en la página web del museo) y es el museo el que se encarga de las labores de restauración y mantenimiento.
En lo que respecta a las exposiciones, encontramos una permanente, cuyo fin es mostrarnos y narrarnos los hechos ocurridos en la dictadura chilena, a través de elementos interactivos y recíprocos que hagan que el visitante reflexione sobre lo ocurrido, mirando las penalidades y muertes y aprendiendo a respetar los Derechos Humanos. Se han mostrado exposiciones itinerantes, basadas en la puesta al público de fragmentos de documentos (de todo tipo) del museo, en otras ciudades, instituciones u organismos, como la de "Nunca más" en Puerto Natales , que nos mostraba objetos personales de las víctimas, con un fin de acercarnos a los sentimientos y emociones más cotidianos. Otros tipos de exposiciones que se han llevado a cabo han sido las siguientes: la exposición "Mala memoria" sobre ilustraciones de violación de Derechos Humanos, realizadas por jóvenes entre 18 y 25 años, exposiciones sobre obras artísticas contemporáneas relacionadas con la Memoria y Chile como la llamada "Expolio", otras de tipo performancecomo "La Geometría de la Conciencia" o como la presentación de un mural inspirado en el último poema de Víctor Jara. Todas son obras de claro carácter cultural y artístico que intenta llevar al espectador a una experiencia más allá de una mera explicación. Las exposiciones que se han realizado anteriormente también se refieren aperformance de varias artistas que han trabajado sobre temas de la Memoria y el sufrimiento de las víctimas. Asimismo, las obras que se expondrán en el futuro próximo presentan el mismo corte.
En cuanto a las actividades, se realizan seminarios, encuentros, se visualizan películas (de hecho uno de sus documentales estuvo nominado al Oscar), girando todos en torno a los temas de la represión en la dictadura, el homenaje a las víctimas, el tema de la Memoria y los Derechos Humanos. Vemos que muchas de estas actividades están realizadas por jóvenes, algo que dota de vida al museo y hace que su eco invada a toda la población. Además, el teatro, la música y la danza también tienen cabida en él: se realizó por ejemplo el Ciclo de Teatro Memoria Escénica hace dos años, ocupándose de la "Irreverencia y rebeldía política", y se desarrollaron tanto talleres infantiles como con las familias de las víctimas; en el ámbito musical, el museo tiene un Auditorio en el que se presentan conciertos de toda índole: jazz, vanguardismo, música clásica, etc. Además, son también interesantes sus programas de danza, que llenan al espectador de sentimientos y cercanía con los casos tratados.
Por otra parte, el museo también cuenta con un Centro de Documentación, en el que encontramos todo tipo de documentos a consultar (también están colgados en Internet para facilitar su divulgación) y está abierto al público, contando con Sala de Consultas. Además, el museo, en ese afán de divulgación y acercamiento al público por medio de la cultura y el arte que nos enseñe lo que pasó en Chile durante la dictadura, realiza actividades para niños, con material educativo especializado y visitas guiadas, para que hasta los más jóvenes no olviden y sepan respetar los Derechos Humanos.